"The 4400" 1. Sezon 3. Bölümünde, 4400 kişinin geri dönmesiyle ortaya çıkan gizemli olaylar devam ederken, bazı 4400'lerin değişik güçlerle donatıldığı keşfedilir. NTAC, bu güçleri ve 4400'lerin niyetlerini anlamaya çalışırken, Shawn da kendisine yeni bir amaç bulur.